Maaperäekosysteemin toiminta on seurausta maaperän organismien ja maaperän ympäristön välisestä vuorovaikutuksesta. Biogeokemian näkökulmasta ekologit uskovat, että maaperä on maapallon pintajärjestelmän aktiivisin elämänkerros, jolla on rikkain biologinen monimuotoisuus ja biogeokemiallinen energianvaihto ja materiaalien kierto (muunnos). Ympäristötieteilijöiden mielestä maaperä on tärkeä ympäristötekijä sekä ympäristön epäpuhtauksien puskuri ja suodatin. Maataloustutkijat ja maanviljelijät uskovat, että maaperä on kasvien kasvun väline, ja he ovat enemmän huolissaan maaperän olosuhteista, jotka vaikuttavat kasvien kasvuun, maaperän hedelmällisyyteen, hedelmällisyyteen ja kestävyyteen. Maaperätutkijat ja agronomit kiinnittävät enemmän huomiota maan pinnalla kehittyvään löysään huokoiseen rakenteeseen, jossa viherkasvit voivat kasvaa.
Eri alojen tutkijoiden huolenaiheiden perusteella maaperäekosysteemien toimintoihin kuuluvat seuraavat näkökohdat:
(1) Maaperä on maan viheralueekosysteemin perusta
Viheralueekosysteemissä maaperä on aktiivisin elämänkerros, itse asiassa suhteellisen itsenäinen osajärjestelmä. Maaperän rooliin maanpäällisissä ekosysteemeissä kuuluvat: 1)biologisen toiminnan, monimuotoisuuden ja tuottavuuden säilyttäminen; (2)veden ja liukoisen virtauksen säätely; (3)orgaanisten ja epäorgaanisten epäpuhtauksien suodattaminen, puskurointi, hajoaminen, kiinnittäminen ja vieroitus (4)Sen tehtävä on varastoida ja kierrättää ravinteita ja muita biosfäärin ja pinnan alkuaineita;
(2) Maaperä on tärkeä osa maan pintajärjestelmän luonnollista maantieteellistä ympäristöä
Pedosfääri peittää maan pinnan ja sijaitsee muiden sfäärien risteyksessä, josta tulee niiden välinen yhteys, muodostaen keskeisen ympäristön, joka yhdistää epäorgaaniset ja orgaaniset maailmat, eli elämän ja ei-elämän välisen yhteyden.
(3) Maaperä on ihmisen maatalouden tuotantopohja
Luonnossa kasvien kasvun ja lisääntymisen on perustuttava maaperään. Maaperällä on seuraavat erityiset korvaamattomat roolit kasvien kasvussa ja lisääntymisessä: (1)Ravinteiden varastoinnin rooli; (2)Ravinteiden muuntaminen ja kierto; (3)Sadevesien suojelu; (4)Biologinen tuki (5)Ympäristömuutosten vakauttamisen ja puskuroinnin rooli.